이 게임은 화면의 모든 체리를 먹거나, 모든 적을 처치하거나, 또는 'EXTRA' 알파벳을 모두 모아 보너스 생명을 얻는 등 다양한 클리어 방법을 제공합니다. 게임이 진행될수록 적의 AI는 더욱 똑똑해지며, 심지어 통로를 파서 플레이어를 추격하기도 합니다. 이러한 높은 자유도와 다양한 전략적 선택은 《Mr. Do!》를 수많은 아류작들 사이에서 돋보이게 만들었으며, 80년대 가장 대표적인 퍼즐 게임 중 하나로 자리매김하게 했습니다.
고득점 플레이어는 보통 체리를 먹는 것에 만족하지 않고 사과 함정을 이용합니다. 땅을 팔 때 수직 통로를 미리 남겨두고, 몬스터가 떼를 지어 쫓아올 때 사과를 밀어 떨어뜨려 한 번에 여러 마리를 처치하면 매우 높은 보너스 점수를 얻을 수 있습니다.
파워볼(Powerball)에 대하여: 이것은 유일한 원거리 호신 무기이지만, 공을 던진 후에는 다시 손으로 돌아와야 재사용할 수 있습니다. 공이 빠르게 튕겨 돌아올 수 있도록 좁고 긴 복도에서 사용하는 것을 추천합니다. 또한, 일정 시간마다 화면 중앙에 음식이 떨어지는데, 이것을 먹으면 알파벳 몬스터가 소환되어 'EXTRA' 보너스를 모을 절호의 기회가 됩니다. 몬스터의 형태 변화를 항상 주시해야 하며, 몬스터가 땅을 파는 형태로 변하면 기존의 미로 경로는 더 이상 안전하지 않게 됩니다.