本作では「ワイリーを探せ」、「ロールを救え」といった異なるストーリー分岐が用意されており、リプレイ性を大幅に高めています。戦闘ではチャージショットの威力が強化され、各キャラクターには固有の超必殺技があります。BGMの多くはシリーズ名曲のアーケードアレンジ版で、パワフルなサウンドが楽しめます。本作の操作感は格闘ゲームに近く、回避や瞬時のカウンターの正確さが重要となります。
『ロックマン・ザ・パワーバトル』では、サポートシステムの活用が極めて重要です。ロックマンはラッシュを呼び出して強力な攻撃形態に変身させることができます。巨大なボスと対峙する際は、ジャンプで低い位置からの攻撃を避け、チャージしてバスターを放ちましょう。本作では特殊武器の使用回数に制限があるため、ここぞという場面で使うようにしましょう。制限時間内にノーダメージでボスを倒すと、システムからより多くのエネルギーアイテムが報酬として与えられます。攻撃力を優先的にアップグレードすることをおすすめします。特に「ワイリールート」を選択した場合、後半のボスは防御力が非常に高く、弱点武器がないと苦戦を強いられます。